La trama di Jurassic World 2, d'altra parte, è per lo più nascosta. Tuttavia, lo scrittore Colin Trevorrow ha detto in precedenza che la storia del sequel affronterà i problemi di abuso di animali in relazione ai dinosauri, che è un territorio in gran parte inesplorato per il franchise. Un recente rapporto sulla produzione indica che i diritti degli animali saranno importanti per la trama come Trevorrow ha fatto sembrare.
Come riportato da Jurassic Outpost, NBCUniversal ha acquistato tre nuovi domini web il 15 dicembre 2016. Tutti e tre i domini offrono sottili accenni alla premessa di Jurassic World 2 solo con i loro nomi: AllCreaturesHaveRights.com (e.org) e IslaNublarRescueMission.com. Il primo allude fortemente alla presenza di una qualche forma di gruppo "per i diritti dei dinosauri" come parte del film, mentre il secondo è un riferimento a Isla Nublar, la sede dei parchi a tema rappresentati sia in Jurassic World che nell'originale Jurassic Park.
Chris Pugh di Jurassic Outpost ha twittato venerdì che "Isla Nublar Rescue Mission" potrebbe alludere al titolo ufficiale di Jurassic World 2, riferendosi alla "mossa rivelatrice" della Universal quando ha acquistato il nome di dominio per "Fate of the Furious". Tuttavia, Pugh trova "improbabile" che il dominio sia effettivamente il titolo di Jurassic World 2. Lo scenario più probabile è che la "Missione di salvataggio" si riferisca a un dispositivo di trama, come un'organizzazione immaginaria … o letteralmente solo una missione reale.
Jurassic Outpost ha teorizzato che la trama di Jurassic World 2 ruoterà attorno alla distruzione del parco e dei dinosauri che lo abitano e alla conseguente battaglia legale ed etica che si verifica. Il rapporto ipotizza che "Isla Nublar Rescue Mission" si riferisca a una missione per salvare i dinosauri, piuttosto che gli esseri umani. Non importa quale sia la trama, è probabile che Jurassic World 2 esplori temi complessi legati ai dinosauri e agli umani che li hanno creati, piuttosto che adottare un approccio più simile a un film di mostri simile ai sequel di Jurassic Park meno memorabili. È una premessa intrigante e un modo rinfrescante per avvicinarsi a un film sui dinosauri in cattività.
Secondo quanto riferito, la premessa di Jurassic World 2 ha colto di sorpresa Bryce Dallas Howard, il che significa che ci sono poche possibilità che il sequel sia un altro film di dinosauri assassino. Bayona ha precedentemente definito il sequel un'avventura di dinosauri "divertente", ma ha anche accennato a elementi politici che giocano un ruolo importante nel film. I nomi di dominio chiariscono che Jurassic World 2 conterrà temi politici, ma non sarà chiaro esattamente che tipo di film vuole essere fino a quando non verranno fuori più nuove informazioni.